Ben daha önce yaptım e imza ile pdf imzaladım. Php doğası gereği e imza tokeni hafızada tutamaz. Ya Chrome eklenti ile istek atacan ya da bazı firmaların ücretsiz araçları var onları kullanacaksın.
https://www.kolayimza.com/api/
Ben bununla yaptım.
Üstekini bilgisayara kuruyorsun örnekde sitesinde var ajax ile masaüstündeki dosyaya istek atıyor özel port açıyor imzalayıp dosyayi sonucuna upload ediyorsun. Örnekler sitesinde var kolay gelsin.