Merhaba,
Reponuzda .env dosyanız görünüyorsa ve .gitignore içerisine .env dosyasını eklediyseniz; öncelikle historyden kaldırmanız gerekir.
Terminalde aşağıdaki kodu çalıştırın.
git rm --cached .env
Daha sonra tekrardan değişiklikleri stage içerisine ekleyin.
git add .
En son commit yapıp, repoya pushlayın.