aghabalaguluzade Farklı farklı dosyaları git add ile ekleyip ayrı ayrı commit atabilirsin.git add app/Http/.../UserController.php
& git commit -m "Updated user controller ..."
şeklinde kaç tane dosyada değişiklik olursa olsun sadece o dosyayı commitlersin. Github CLI, vscode veya kullandığınız kod editörünün github ile entegrasyonu varsa oradan daha rahat yapabilirsin, tek tek dosyaları seçer commitler sonra push edersin.