@mgsmus en güzel şekilde açıklamış, ben küçük bir ekleme yapmak istiyorum.
$table->index(['id', 'user_id', 'falan', 'filan', 'mesela']);
şeklinde kayıtları indexlediğiniz zaman Laravel sizin için bir index key oluşturur, bu isim ise belirli bir uzunluğun üstündeyse hata ile karşılaşabilirsiniz, bunun önüne geçmek için ikinci parametre ile name'e kendiniz verebilirsiniz:
$table->index(['id', 'user_id', 'falan', 'filan', 'mesela'], 'notification_indexes');
gibi.